Spätestens mit dem Ende des Dreißigjährigen Krieges 1648 war Österreich wieder mehrheitlich katholisch. Zahlreiche bedeutende barocke Klosterbauten wurden errichtet – zunächst in der Steiermark, z. B. Seckau, St. Lambrecht, etwas später in Oberösterreich Schlierbach und St. Florian –, entweder durch Renovierung und Anpassung mittelalterlicher Bauten (wie z. B. die Stiftskirche von Klosterneuburg) oder durch Neubauten, die sich nun vorwiegend an der Schlossarchitektur orientierten.

Ab der Mitte des 17. Jahrhunderts hatte jedes Stift einen Kaisersaal oder Kaisertrakt, was aus der Tradition des Gastungsrechtes des Lehnsherrn herrührte. Wenn der Kaiser in Klöstern nur selten längere Zeit hindurch anwesend war, sollte die Architektur dennoch die Verbindung von weltlicher und geistlicher Macht symbolhaft zum Ausdruck bringen.

In den Alpenländern, in denen der Katholizismus nie verschwunden war, bestand eine rege Nachfrage nach Kirchenausstattungen. Bildhauerwerkstätten wie jene der Familien Schwanthaler oder Zürn arbeiteten für Pfarr-, Wallfahrts- und Klosterkirchen und schufen abseits städtischer Zentren bedeutende Werke.